Knubbsälar vilar gärna på grynnor eller skär. Ofta ser man dem då tillsamman i grupper på flera tiotals djur. Sälar kan också sova i vattnet. När de behöver andas går de upp till ytan, utan att vakna.

Knubbsälar dyker oftast till några få meters djup i 5-10 minuter. Ibland dyker de till åtminstone 100 meters djup och håller andan i en halvtimma.